JSME是由 Peter Ertl 开发的基于网页Javascript的分子结构编辑器applet, 前身是基于JAVA的JME,JMEwiki. 现在在JSmol里也收录JSME,例如. JSME支持画各种简单的小分子,界面简单方面,也支持使用SMILES式来生成(直接黏贴也行),并且支持快捷键来快速切换,也能将分子输出为文件.
JSME接口可以用于将输入分子用于化学数据库搜索, 可以用子结构搜索(使用SMARTS式).

更多的分子编辑器如Chemdraw,网页可用的如Marvin,Chemdoodle,Chemwriter,Ketcher等,更多请参考Ref2.

安装

• 下载可以去官网下载最新版, 下载JSMol也带有JSME文件夹,可以基本调用JSME.

使用

• 直接通过预设图标来画结构.画反应需要使用options:reaction,此时会有个箭头和new(新建分子),123.
• 拖文件到窗口内或者直接黏贴内容, 支持Mol,SMILES, SDF, RXN文件.
• 右下角的图标(三角或一个结构),鼠标右键按着拖拉到word/Txt可以将其mol文件格式拖出去.
• 其他图标的说明请参考help
• 一些例子

Reference

1. Perter-Etrl开发者主站,Ref.
2. 分子编辑器.